当然任何改革其实都有一个原则，那就是老人老办法，新人新办法。就像现在国有企业，全部取消了编制，改用控制工资总额的方式进行管理，其实对职工的影响也不是那么大。县级以上的医院规模大，专业性、技术性比较强，取消编制实行聘用制管理以后，有利于医院吸引人才，促进人才的合理有序流动。
但在编制没有取消之前，三级医院的编制内人员和聘用人员的区别还是比较大的。主要的区别有这么几个方面：
一是身份不同。编制内的医护人员属于国家公职人员，体制内人员，是国家干部，端的是铁饭碗。聘用人员属于合同制职工，属于体制外的人员，合同期满可以续聘，也可以终止聘用合同，端的是泥饭碗。
二是五险一金的缴费方式不同。编制内人员和聘用人员都要缴纳五险一金。编制内人员缴纳的是机关事业单位养老保险，还要缴纳职业年金；聘用人员缴纳的是企业职工基本养老保险，不能缴纳职业年金。高端的聘用人员可以缴纳企业年金，但需要在聘用合同中约定。
三是工资福利待遇不同。编制内人员，基本工资、薪级工资是按照国家规定执行，绩效工资是按照医院的规定执行，工资的正常增长机制是比较完善的；聘用人员是按照聘用合同约定的工资方式执行，有的聘用人员的工资可能会高于编制内人员，但多数聘用人员的工资会低于编制内人员。
四是退休待遇不同。编制内人员是按照机关事业单位养老保险办理退休，特别是视同缴费指数的计算办法和企业职工不一样；退休后不但有基本养老金，还有职业年金，有的还要享受退休后的生活补贴；编制外人员是按照企业职工基本养老保险的规定办理退休，没有职业年金，退休后也无法享受单位的生活补贴待遇。
综上所述，在三级医院工作，同样是医院的职工，但编制内人员享受的各项待遇要普遍高于编制外人员。编制外人员中除了高端的医务人员以外，各项待遇都会低于编制内人员。但以后随着三级医院编制的取消，所有人都实行聘用人员，一个单位两种制度的情形才会得到根本改变。
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